SkypeのIDの削除についてぐぐると例えばこんなサイトが見つかる。
さて、肝心の削除方法ですが、実は、Skypeには能動的にアカウントを削除する方法が存在しません。
（略）
では、どうしたらいいのかというと、「放置する」ということになります。Skypeでは、一週間ログインせずに放置すると、ユーザーの情報がSkypeサーバーのユーザー情報フォルダから削除されます。
しかし、これは大嘘。このバリエーションで6ヶ月で削除なんて書いてあるサイトもあるが、それも嘘。
実際2年ほど放置してみたが、いつまでたってもID検索で見つかってしまう。